第二炮兵總醫(yī)院病理科成立于1975年，前身為北京軍區(qū)262醫(yī)院病理科，經(jīng)過30余年發(fā)展積累，科室秉持“志存高遠，博學內(nèi)斂，精誠仁信，一諾千金”的工作理念，建設臨床、科研相結(jié)合的綜合性病理診斷平臺。病理科已建成擁有自動染色封片系統(tǒng)、自動免疫組化儀、熒光顯微鏡、五人共覽顯微鏡、高速冷凍離心機、熒光定量PCR儀等一流核心設備的常規(guī)病理診斷平臺，開展活體組織病理診斷、術中冰凍病理診斷、快速石蠟病理診斷、免疫組化病理診斷、液基細胞病理診斷、基因病理診斷等特色技術十余項，其中常規(guī)疾病的診斷處于國內(nèi)同級別醫(yī)院較高水平。擁擁有一支博士碩士為主體，高中初匹配的診斷醫(yī)師和技師團隊?，F(xiàn)有醫(yī)師6名，技師6名，其中主任醫(yī)師1名，主治醫(yī)師4名，博士1名，碩士3名。同時聯(lián)合腫瘤科、醫(yī)學影像科、放療中心、肝膽外科B區(qū)組建了腫瘤醫(yī)學研究所；聯(lián)合北京師范大學生命科學院成立了轉(zhuǎn)化醫(yī)學中心；聯(lián)合醫(yī)學影像科成立了數(shù)字病理影像遠程會診中心。使科室工作在常規(guī)病理、疑難病理、遠程會診、病理信息化及醫(yī)學科研領域整體推進，以實現(xiàn)服務臨床、服務患者的根本任務。
